ネメシスクライシス……銀河たちと破壊神の戦いから７年。世界はようやく復興し、ベイブレードもまた新たな時代を迎えていた。そんな中、地元で１００連勝を達成した新たな主人公、黒銀ゼロはベイ『サムライイフレイド』と共に武者修行の旅に出る。目指すはかつてベイブレードの聖地と呼ばれた街だった。