ゼオがスカウトされたベイブレードジム・HDアカデミー。ゼオを僅かな期間で世界大会に出られる実力者に育てるなど、謎の多い場所だ。その主宰者、Ｄｒ．ジグラットは己の研究の為、竜牙とメテオエルドラゴをアカデミーに招いていた。そこで明かされる秘密。何とジグラットはダークネビュラの仕掛け人であり、当時から竜牙に注目していたいうのだ。そして彼はメテオエルドラゴの真の力を我が物にしようと企んでいた！