アメリカで奪われた石版の行方を追って急ぎ日本へと戻ってきたタカオたち。出迎えた大転寺会長は、かつて自分も不思議なエネルギーを発する石版の研究に携わっていた経験を語った。そしてザガートという人物により石版が奪われたことも。その後カイやレイは石版の捜索に加わり、タカオは完成したドラグーンＶ２のテストとしてキョウジュと練習試合を行う。が、新たなドラグーンは予想以上に扱いにくいベイとなっていた……。